Состав записи 1FL2 банка PDB



Заголовок структуры: Оксидоредуктаза 11-AUG-00 1FL2
Название структуры: каталитический центр алкилгидропероксидредуктазы AHPF E.coli
В документе представлены следующие цепи макромолекул:
Идентификатор цепи Число остатков Название молекулы Комментарии
A
310
 алкилгидропероксидредуктаза F52A белок (домен C-конца)
(номера остатков с 212 по 521) 		Тип белка: альфа*бета
Организм: ESCHERICHIA COLI
Метод: рентген-дифракция
Авторы: B.BIEGER,L.-O.ESSEN
В документе представлены следующие низкомолекулярные вещества:
ID Название Формула Число копий Комментарии
SO4 SULFATE ION (O4 S 2-) 5 Сульфат-ион
FAD FLAVIN-ADENINE DINUCLEOTIDE C27 H33 N9 O15 P2 1 Флавинадениндинуклеотид
CHAIN A

Кол-во альфа-спиралей 9

Кол-во бета-тяжей 33

Кол-во бета-поворотов 36

Размер в ангстремах - asp436a.od1-lys519a.nz равен 72. Аппроксимируем молекулу сферой радиусом 36 ангстрем.

Vбелка=4/3*3.14*36^3=195432 кубических ангстрем

Аппроксимируем клетку бактерии цилидром высотой 2 мкм и радиусом 0,5 мкм.

Vклетки=3.14*5000^2*20000=1.571*10^12 кубических ангстрем

1.В одной клетке E.coli поместится ~8 млн молекул алкилгидропероксид редуктазы.

2.Если допустить, что молекулы всех 4400 видов белков E.coli имеют размеры алкилгидропероксидредуктазы, то в бактерии поместится 1818 молекул белка каждого вида.

3.18 молекул алкилгидропероксидредуктазы поместится на линейке длиной 0,13 мкм.

К перечню исследовательских работ
На главную