Филогенетическое дерево.


Название Мнемоника
Agrobacterium tumifaciens AGRRK
Rhizobium etli RHIEC
Ralstonia pickettii RALPJ
Neisseria meningitidis NEIMA
Escherichia coli ECOLI
Yersinia pseudotuberculosis YERPS
Haemophilus influenzae HAEIN
Salmonella typhimurium SALTY



Скобочная формула дерева: ((AGRRK, RHIEC), ((RALPJ, NEIMA), (((ECOLI, SALTY), YERPS), HAEIN)));

Изображение дерева:





Нетривиальные ветви:

1) {AGRRK, RHIEC}, {RALPJ, NEIMA, ECOLI, SALTY, YERPS, HAEIN}
2) {RALPJ, NEIMA}, {AGRRK, RHIEC, ECOLI, SALTY, YERPS, HAEIN}
3) {ECOLI, SALTY}, {AGRRK, RHIEC, RALPJ, NEIMA, YERPS, HAEIN}
4) {ECOLI, SALTY, YERPS}, {AGRRK, RHIEC, RALPJ, NEIMA, HAEIN}
5) {ECOLI, SALTY, YERPS, HAEIN}, {AGRRK, RHIEC, RALPJ, NEIMA}

Таксономия и реконструкция филогении

Название Мнемоника Таксономия и реконструкция филогении
Agrobacterium tumifaciens AGRRK cellular organisms; Bacteria; Proteobacteria; Alphaproteobacteria; Rhizobiales; Rhizobiaceae; Rhizobium/Agrobacterium group; Agrobacterium
Rhizobium etli RHIEC cellular organisms; Bacteria; Proteobacteria; Alphaproteobacteria; Rhizobiales; Rhizobiaceae; Rhizobium/Agrobacterium group; Rhizobium
Ralstonia pickettii RALPJ cellular organisms; Bacteria; Proteobacteria; Betaproteobacteria; Burkholderiales; Burkholderiaceae; Ralstonia
Neisseria meningitidis NEIMA cellular organisms; Bacteria; Proteobacteria; Betaproteobacteria; Neisseriales; Neisseriaceae; Neisseria
Escherichia coli ECOLI cellular organisms; Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Enterobacteriales; Enterobacteriaceae; Escherichia
Yersinia pseudotuberculosis YERPS cellular organisms; Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Enterobacteriales; Enterobacteriaceae; Yersinia; Yersinia pseudotuberculosis complex
Haemophilus influenzae HAEIN cellular organisms; Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Pasteurellales; Pasteurellaceae; Haemophilus
Salmonella typhimurium SALTY cellular organisms; Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Enterobacteriales; Enterobacteriaceae; Salmonella; Salmonella enterica; Salmonella enterica subsp. enterica



Результат, полученный с помощью поиска в таксономическом сервисе NCBI, показывает, что некоторые таксономические разделения продемонстрированы и в нетривиальных ветвях.
К примеру, представители нетривиальной ветви {AGRRK, RHIEC} принадлежат к одному семейству Rhizobiaceae и группе Rhizobium/Agrobacterium group.
Рассмотрим другую нетривиальную ветвь: {ECOLI, SALTY, YERPS, HAEIN}. Представители ECOLI (Escherichia coli), SALTY (Salmonella typhimurium) и YERPS (Yersinia pseudotuberculosis) принадлежат к одному порядку Enterobacteriaceae, а HAEIN (Haemophilus influenzae) с другими объединяет только класс Gammaproteobacteria, а порядки уже отличаются.

СПАСИБО ЗА ПРОСМОТР


© Мария Медведева