Классификация
Царство: Bacteria
Раздел: Bacteria
Тип: Actinobacteria
Класс: Actinobacteria
Подкласс: Actinobacteridae
Отряд: Actinomycetales
Подотряд: Corynebacterineae
Семейство: Gordoniaceae
Род: Gordonia
Вид: Gordonia bronchialis
G.bronchialis - нитчатый грам-положительный актиномицет, патогенный для человека, который был выделена из различных тканей человека. Идентификация бактерий в тканях возможна лишь при распознавании 16S рРНК последовательностей, отличия в которых служат для разделения бактерий по родам и видам, поэтому секвенирование ее генома было необходимо.
Филогения
Данные по геному и протеому:
Геном
Репликон |
Всего генов |
Гены, кодирующие белки |
Гены, кодирующие РНК |
Псевдогены |
Размер (в кол-ве пар оснований) |
Хромосома |
4923 |
4868 |
55 |
253 |
5,208,602 |
Плазмида |
80 |
80 |
0 |
0 |
81,410 |
Всего |
5003 |
4948 |
55 |
253 |
5,920,012 |
Протеом
Метаболические пути |
213 |
Ферментативные реакции |
1147 |
Транспортные реакции |
64 |
Полипептиды |
4695 |
Комплексы белков |
6 |
Ферменты |
940 |
Переносчики |
99 |
Композиции белков |
938 |
Транскриптоны |
3280 |
тРНК |
55 |
Результаты поиска статей в PubMed в период с 2000 года:
1)
Complete genome sequence of Gordonia bronchialis type strain (3410)
2010 Jan 28;2(1):19-28.
2)
Gordonia defluvii sp. nov., an actinomycete isolated from activated sludge foam.
2006 Oct;56(Pt 10):2265-9.
Запрос:"Gordonia bronchialis DSM AND complete genome 2000/01:2011/10[dp]"
Использовались материалы
отсюда
Картинки взяты
отсюда и
отсюда