Изучение контактов в молекуле белка SPSE (PDB ID 1VLI)

1. Гидрофобные взаимодействия

Для примера выбран PHE35
Контакты:
ALA 34, 36
ASP 32, 39
ILE 38
LEU 31
PRO 93
TYR 97
GLN 33
Всего 9 а.о., в гидрофобный контакт входят 59 атомов



2. Водородные связи: O—H... :O

Водородных связей между атомами остова: 224
В качестве примера выбраны:
TYR141.A и GLU112.A
Расстояние - 4,16 ангстрем



3. Водородные связи: N—H... :N


В качестве примера выбраны:
ARG338A.NH2
HIS336A.NE1
Расстояние - 3,34 ангстрем



3.Дисульфидные связи



В моем белке дисульфидных мостиков не обнаружено


© Marina Kalinina