Белок в Uniprot



2.Информация о белке
Пункты Метка поля Содержание
Код(ы) доступа ("Accession number") AC P39625
Идентификатор записи в БД ID SPSE_BACSU
Название (краткое описание) белка DE RecName: Full=Spore coat polysaccharide biosynthesis protein spsE
Дата создания документа DT 01-FEB-1995
Дата последнего исправления аннотации DT 25-JAN-2012, entry version 78
Число публикаций, использованных при создании документа RN 1
Журнал и год самой поздней публикации RL Mol. Microbiol. 10:371-384(1993)
Ключевые слова KW 3D-structure; Complete proteome; Reference proteome
Что содержит поле комментариев? CC -!- PATHWAY: Spore coat biogenesis; spore coat polysaccharide biosynthesis.
-!- SIMILARITY: Contains 1 AFP-like domain.
-----------------------------------------------------------------------
Copyrighted by the UniProt Consortium, see http://www.uniprot.org/terms
Distributed under the Creative Commons Attribution-NoDerivs License
----------------------------------------------------------------------
Поле комментариев содержит путь, сходство, права на копирование.
Идентификаторы записей PDB DR EMBL; X73124; CAA51623.1; -; Genomic_DNA.
EMBL; AL009126; CAB15813.1; -; Genomic_DNA.
PIR; S39722; S39722.
RefSeq; NP_391666.1; NC_000964.3.
PDB; 1VLI; X-ray; 2.38 A; A=1-373.
PDBsum; 1VLI; -.
ProteinModelPortal; P39625; -.
SMR; P39625; 2-368.
EnsemblBacteria; EBBACT00000002980; EBBACP00000002980; EBBACG00000002974.
GeneID; 937233; -.
GenomeReviews; AL009126_GR; BSU37870.
KEGG; bsu:BSU37870; -.
NMPDR; fig|224308.1.peg.3792; -.
PATRIC; 18979614; VBIBacSub10457_3969.
GenoList; BSU37870; -.
GeneTree; EBGT00050000002849; -.
HOGENOM; HBG678873; -.
OMA; EAGINHD; -.
PhylomeDB; P39625; -.
ProtClustDB; CLSK888082; -.
BioCyc; BSUB:BSU37870-MONOMER; -.
GO; GO:0003824; F:catalytic activity; IEA:InterPro.
GO; GO:0016051; P:carbohydrate biosynthetic process; IEA:InterPro.
InterPro; IPR006190; AFP_Neu5c_C.
InterPro; IPR013785; Aldolase_TIM.
InterPro; IPR013132; Neu5Ac_N.
InterPro; IPR013974; SAF.
Gene3D; G3DSA:3.20.20.70; Aldolase_TIM; 1.
Gene3D; G3DSA:3.90.1210.10; G3DSA:3.90.1210.10; 1.
Pfam; PF03102; NeuB; 1.
Pfam; PF08666; SAF; 1.
SMART; SM00858; SAF; 1.
SUPFAM; SSF51269; AFP_Neu5c_C; 1.
PROSITE; PS50844; AFP_LIKE; 1.
3. Некоторые факты о белке.
Вопрос Ответ
Какие ионы связываются с белком? Ион цинка.

4.Определите, сколько белков в UniProt имеют тот же код белка или примерно то же описание (DE)
Команда/Запрос Число записей в SwissProt Число записей в TrEMBL
infoseq sw:spse_* -only -description -noheading | wc -l 1 -
spse 3 1467
"Spore coat polysaccharide biosynthesis protein" 12 412
"polysaccharide biosynthesis protein" 36 9079
"Spore coat" 217 6245