head
первый семестр второй семестр главная страница

Занятие 11. PSI-BLAST

ID белка AC белка Число итераций Для первой итерации Для последней итерации
Число находок выше порога (0,005) Худшее E-value выше порога Лучшее E-value ниже порога Число находок выше порога (0,005) Худшее E-value выше порога Лучшее E-value ниже порога
MINC_ECOLI P18196 5 162 0,005 0,005 881 0.002 0.094
SSRP_ECOLI P0A832 2 514 3e-10 5.4 514 5e-31 0,35
RP5M_RHIME P17265 4 15 0,005 0,12 25 8e-15 0,025
XPT_BACSU P42085 280 0.005 0.005 1843 0.005 0.009

Поиск для последовательностей, для которых список не стабилизировался после пятой итерации, порог совпадения изменен с 0,005 на 0,001 .

ID белка AC белка Число итераций Для первой итерации Для последней итерации
Число находок выше порога (0,001) Худшее E-value выше порога Лучшее E-value ниже порога Число находок выше порога (0,001) Худшее E-value выше порога Лучшее E-value ниже порога
MINC_ECOLI P18196 3 155 0.001 0.001 188 3e-10 0.001
XPT_BACSU P42085 7 225 0.001 0.001 1849 2e-04 0.005

Правильный CSS! Valid HTML 4.01 Transitional


© Almukhametov Azat