Uniprot и Refseq Proteins

Основная информация о белке

Uniprot IDF7IX06_9ACTN
Uniprot ACF7IX06
RefSeq ID-
PDB ID3VIS
Длина300 AA
Молекулярная масса32353 (Da)
Рекомендуемое Uniprot названиеEsterase

Комментарии к таблице:

  • Unreviewed
  • Cостоит из двух цепей
  • Есть лиганд

    Поиск по кластерам

    Идентификатор кластераИмяКоличество белков в кластереДлинаОрганизм
    UniRef100_F7IX06Esterase1300Thermobifida alba
    UniRef90_F7IX06Esterase2300Thermobifida alba
    UniRef50_ F7IX06Esterase484300Много

    Видно, что для кластеров с высоким процентом сходства (90% и 100%) было найдено мало белков (2 и 1 соответственно), притом оба у одного организма Thermobifida alba. В то же время белков, относящихся к кластеру, имеющему сходство с исследуемым белком на 50%, было найдено сравнительно много (484); и они были представлены в разных организмах.

    Сеансы поиска в Uniprot(Advanced)

    Цель запросаТекст запросаКоличество найденных белковReviewed
    Поиск по рекомендованному названиюname:esterase87 826724
    Поиск по тому же названию среди белков из организмов того же семействаname:esterase taxonomy:nocardiopsaceae960
    Поиск по тому же названию среди белков из организмов того же отделаname:esterase taxonomy:actinobacteria20 77412
    Поиск по названию гемоглобин в таксоне позвоночные (Vertebrata)name:hemoglobin taxonomy:vertebrata11 807944
    Поиск по названию гемоглобин в таксоне членистоногие (Arthropoda)name:hemoglobin taxonomy:arthropoda7570
    Поиск по названию гемоглобин в таксоне животные (Metazoa)name:hemoglobin taxonomy:metazoa3 630838
    Поиск по названию трипсинname:trypsin15 308310
    Поиск, позволяющий различить трипсин и его ингибиторовname:trypsin NOT name:inhibitor12 089101

    Результаты поиска позволяют сказать, что белков относящихся к эстеразам в целом достаточно много (87,826), и весьма значительную часть этих белков составляют эстеразы, представленные в отделе актинобактерий (20,774, что составляет 23,55%). Однако в семействе nocardiopsaceae данные белки встречаются довольно редко (96, что составляет 0,11%).

    К семестрам


    © Енькова Анна, 2017