EMBOSS и выравнивания геномов

По оси абсцисс располагается геном Desulfurococcus kamchatkensis

По оси ординат — геном Desulfurococcus fermentans

Было выбрано три примера: А, В, С

Участок А : участок генома [A] Desulfurococcus kamchatkensis(Х) располагается геноме Desulfurococcus fermentans(Y) дальше, чем в геноме(Х), т.е. можно предположить транслокацию участка в одном из геномов. Также можно предположить, что это результат прочтения последовательностей c различных начальных координат.

Участки В : [B] перевернуты, т.е. в одном из геномов произошли инверсии этих участков.

Участки С : в каком-то из геномов отсутствует фрагмент. Это может быть как результат вставки в геноме( X), так и делеции в геноме (Y).

Таким образом, гомологичные участки занимают большую часть геномов.

К семестрам


© Енькова Анна, 2017