Что такое филогенетическое дерево
Цель занятия: поработать с филогенетическим деревом нескольких бактерий.
Из данного в задании списка бактерий отдела Firmicutes выбрала следующие назания:
Название |
Мнемоника |
Bacillus subtilis |
BACSU |
Clostridium tetani |
CLOTE |
Finegoldia magna |
FINM2 |
Lactobacillus delbrueckii |
LACDA |
Listeria monocytogenes |
LISMO |
Staphylococcus epidermidis |
STAES |
Streptococcus pneumoniae |
STRPN |
Руководствуясь приведённым филогенетическим деревом, нарисовала дерево выбранных организмов:
(я конечно воспользовалась программой MEGA, но свои усилия оказались мне ближе)
Скобочная формула дерева: ((CLOTE,FINM2),((LACDA,STRPN),((BACSU,LISMO),STAES)))
Нетривиальные ветви дерева:
1) {CLOTE,FINM2} против {LACDA,STRPN,BACSU,LISMO,STAES}
2) {LACDA,STRPN} против {CLOTE,FINM2,BACSU,LISMO,STAES}
3) {BACSU,LISMO} против {STAES,CLOTE,FINM2,LACDA,STRPN}
4) {BACSU,LISMO,STAES} против {CLOTE,FINM2,LACDA,STRPN}
©Melnichuk Anastasia