Что такое филогенетическое дерево
Цель занятия: поработать с филогенетическим деревом нескольких бактерий.
Из данного в задании списка бактерий отдела Firmicutes выбрала следующие назания:
| Название |
Мнемоника |
| Bacillus subtilis |
BACSU |
| Clostridium tetani |
CLOTE |
| Finegoldia magna |
FINM2 |
| Lactobacillus delbrueckii |
LACDA |
| Listeria monocytogenes |
LISMO |
| Staphylococcus epidermidis |
STAES |
| Streptococcus pneumoniae |
STRPN |
Руководствуясь приведённым филогенетическим деревом, нарисовала дерево выбранных организмов:
(я конечно воспользовалась программой MEGA, но свои усилия оказались мне ближе)
Скобочная формула дерева: ((CLOTE,FINM2),((LACDA,STRPN),((BACSU,LISMO),STAES)))
Нетривиальные ветви дерева:
1) {CLOTE,FINM2} против {LACDA,STRPN,BACSU,LISMO,STAES}
2) {LACDA,STRPN} против {CLOTE,FINM2,BACSU,LISMO,STAES}
3) {BACSU,LISMO} против {STAES,CLOTE,FINM2,LACDA,STRPN}
4) {BACSU,LISMO,STAES} против {CLOTE,FINM2,LACDA,STRPN}
©Melnichuk Anastasia