Главная Семестры Проекты Обо мне

Что такое филогенетическое дерево

Цель занятия: поработать с филогенетическим деревом нескольких бактерий.

Из данного в задании списка бактерий отдела Firmicutes выбрала следующие назания:

Название Мнемоника
Bacillus subtilis BACSU
Clostridium tetani CLOTE
Finegoldia magna FINM2
Lactobacillus delbrueckii LACDA
Listeria monocytogenes LISMO
Staphylococcus epidermidis STAES
Streptococcus pneumoniae STRPN


Руководствуясь приведённым филогенетическим деревом, нарисовала дерево выбранных организмов:

(я конечно воспользовалась программой MEGA, но свои усилия оказались мне ближе)

Скобочная формула дерева: ((CLOTE,FINM2),((LACDA,STRPN),((BACSU,LISMO),STAES)))

Нетривиальные ветви дерева:
1) {CLOTE,FINM2} против {LACDA,STRPN,BACSU,LISMO,STAES}
2) {LACDA,STRPN} против {CLOTE,FINM2,BACSU,LISMO,STAES}
3) {BACSU,LISMO} против {STAES,CLOTE,FINM2,LACDA,STRPN}
4) {BACSU,LISMO,STAES} против {CLOTE,FINM2,LACDA,STRPN}


©Melnichuk Anastasia