Классификация ферментов EC

1.Сбор информации о своем ферменте

DLDH_HUMAN-фермент который будет исследоваться в этой работе.
Соберем все базовые данные о ферменте через запись в банке SwissProt/UniProt.

     Full=Dihydrolipoyl dehydrogenase, mitochondrial

Перевод=Митохондриальная дегидрогеназа дигидролипоамида
EC=1.8.1.4
1.---оксиредуктазы
1.8- маленький подкласс, реагирующий с неорганическими и органическими тиолами.
1.8.1 - с НАДФ(+) и НАД(+) в качестве акцепторных ионов.
IntEnz
Функция: Принимает участие в процессах расщепления, как глицина, так и альфа-кетокислотных-дегидрогеназных сложных соединений.

Реакция:
Protein N(6)-(dihydrolipoyl)lysine + NAD(+) <=> protein N(6)-(lipoyl)lysine + NADH
     

formatdb -i EC.fasta -p T -n base
blastall -p blastp -d base -i EC.fasta -e 1 -o blastp.out

sp|P24815|3BHS1_MOUSE 3 beta-hydroxysteroid dehydrogenase/Delta ...   736   0.0  
sp|O35469|3BHS6_MOUSE 3 beta-hydroxysteroid dehydrogenase/Delta ...   626   0.0  
sp|P26149|3BHS2_MOUSE 3 beta-hydroxysteroid dehydrogenase/Delta ...   619   0.0  
sp|P26150|3BHS3_MOUSE 3 beta-hydroxysteroid dehydrogenase/Delta ...   615   0.0  
sp|Q61767|3BHS4_MOUSE 3 beta-hydroxysteroid dehydrogenase type 4;     552   0.0  
sp|Q61694|3BHS5_MOUSE 3 beta-hydroxysteroid dehydrogenase type 5;     538   0.0  
sp|Q9EQC1|3BHS7_MOUSE 3 beta-hydroxysteroid dehydrogenase type 7;     231   2e-73
sp|Q9D665|D42E1_MOUSE Short-chain dehydrogenase/reductase family...   108   4e-28
sp|Q9R1J0|NSDHL_MOUSE Sterol-4-alpha-carboxylate 3-dehydrogenase...   101   8e-26
sp|Q8K3F7|TDH_MOUSE L-threonine 3-dehydrogenase, mitochondrial;        33   0.005
sp|Q7TNT2|FACR2_MOUSE Fatty acyl-CoA reductase 2;                      30   0.064