Главная Семестры Проекты Обо мне

Задание d5: Сравнение доменов SCOP и Pfam

Для структуры 1WPV был произведен поиск доменов в SCOP и Pfam
Находятся следующие домены: 
Pfam: домен HutP с координатами границ 8 - 146. 
SCOP: домен
d1veab_ с координатами границ 2 - 148
Границы доменов можно увидеть на рисунке 1.

 

Рис.1 А цепь белка 1WPV. Красным цветом изображен домен из Pfam, синим - из SCOP.

Видно, границы доменов похожи, но у Pfam домены меньше и включены в домены SCOP. Это можно объяснить тем, что в SCOP расположены структурные домены, а в Pfam - функциональные. 


©Melnichuk Anastasia