Информация о бактерии Eggerthella Lenta

Eggerthella lenta - вид грамположительных анаэробных, не спорообразующих, мезофильных неподвижных бактерий , до 1999 года ранее называемый eubacterium lentum. Eggerthella lenta имеют палочкообразную форму, растут в одиночку, парами или в цепочках.
Род eggerthella назван в честь обнаружившего в 1935 году бактерии eggerthella lenta американского микробиолога Арнольда Эггерта (англ. Arnold Eggerth)
Eggerthella lenta по современной систематики относится к роду Eggerthella, который входит в семейство Coriobacteriaceae, порядок Coriobacteriales, класс Actinobacteria, тип Actinobacteria, царство Бактерии. Ранее eggerthella lenta включали в род эубактерий.
Eggerthella lenta встречается у здоровых людей в толстой и тонкой кишке, желудке и других органах. Её рост стимулируется аргинином.[1]

АтрибутЗначение%от общего
Размер генома (б.п.)3632260100
Кодирующая область ДНК (б.п.)321140588,41
Содержание G+ C в ДНК (б.п.)232207864,20
Количество репликонов1
Внехромосомных элементов0
Всего генов3181100
РНК-генов581.67
рРНК оперонов3
Генов,кодирующих белок312398.18
Псевдогены531.67
Гены с предсказанной функцией225570.89
Гены с сигнальными пептидами78124.55
Гены белков,имеющих трансмембранные спирали.99031.12
CRISPR повторов1

Eggerthella lenta способна деконъюгировать желчные кислоты, таким образом вмешиваясь в их метаболизм (Добровольский О.В., Сереброва С.Ю.).

Eggerthella lenta была выбрана для секвенирования для изучения филогенетической позиции. Секвенирование ее генома является частью G enomic E ncyclopedia B acteria и A rchaea(GEBA) проекта.

Таксономия бактерии:[2]
› cellular organisms
   › Домен Bacteria
     › Тип Actinobacteria
       › Класс Actinobacteria
         › Подкласс Coriobacteridae
           › Порядок Coriobacteriales
             › Подпорядок Coriobacterineae
               › Семейство Coriobacteriaceae
                 › Род Eggerthella


Одна из статей PubMed:[1]

Идентификатор статьи в PubMed(PMID): 21304654
Запрос: ((Eggerthella lenta[Title]) AND ("2000/01/01"[Date - Publication] : "2013"[Date - Publication])) AND genome

Stand Genomic Sci. 2009 Sep 28;1(2):174-82. Complete genome sequence of Eggerthella lenta type strain (IPP VPI 0255). Saunders E, Pukall R, Abt B, Lapidus A, Glavina Del Rio T, Copeland A, Tice H, Cheng JF, Lucas S, Chen F, Nolan M, Bruce D, Goodwin L, Pitluck S, Ivanova N,Mavromatis K, Ovchinnikova G, Pati A, Chen A, Palaniappan K, Land M, Hauser L, Chang YJ, Jeffries CD, Chain P, Meincke L, Sims D, Brettin T, Detter JC,Guker M, Bristow J, Eisen JA, Markowitz V, Hugenholtz P, Kyrpides NC, Klenk HP, Han C.

Abstract
Eggerthella lenta (Eggerth 1935) Wade et al. 1999, emended Wurdemann et al. 2009 is the type species of the genus Eggerthella, which belongs to the actinobacterial family Coriobacteriaceae. E. lenta is a Gram-positive, non-motile, non-sporulating pathogenic bacterium that can cause severe bacteremia. The strain described in this study has been isolated from a rectal tumor in 1935. Here we describe the features of this organism, together with the complete genome sequence, and annotation. This is the first complete genome sequence of the genus Eggerthella, and the 3,632,260 bp long single replicon genome with its 3123 protein-coding and 58 RNA genes is part of the Genomic Encyclopedia of Bacteria and Archaea project.


Предисловие
Eggerthella lenta [(Eggerth 1935) Уэйд и соавт. 1999, исправлена Wurdemann и соавт. 2009] - это типовой вид рода Eggerthella, который относится к актинобактериям семейства Coriobacteriaceae. Е. lenta является грам-положительной, неподвижной, не спорообразующей патогенной бактерией, которая может вызывать серьезные бактериемии. Штамм, описанный в данном исследовании был выделен из ректальных опухолей в 1935 году. Здесь мы опишем особенности этого организма, вместе с полной последовательностью генома и аннотацией. Это первая полная последовательность генома рода Eggerthella, и 3632260 пар оснований одного репликона генома с его 3123 белок-кодирующими и 58 РНК-генами является частью проекта Геномной Энциклопедии Бактерий и Архей.

Источники информации:

  1. Elizabeth Saunders,Rudiger Pukall, et.al Complete genome sequence of Eggerthella lenta type strain (IPP VPI 0255T), Stand. Genomic Sci. 2009 1:(2) , [pmid : 21304654 ]
    Ссылка на полный текст статьи (Free full text)
  2. Таксономия Eggerthella lenta на сайте uniprot

© Nuzhdina Ekaterina, 2012