|
Кислород-независимая копропорфириноген оксидаза III (OXYGEN-INDEPENDENT COPROPORPHYRINOGEN III OXIDASE). |
Аминокислотная последовательность белка Hemn_E.coli
>hemN, coproporphyrinogen III oxidase, SAM and NAD(P)H dependent, oxygen-independent
MSVQQIDWDLALIQKYNYSGPRYTSYPTALEFSED
FGEQAFLQAVARYPERPLSLYVHIPFCHKLCYFCG
CNKIVTRQQHKADQYLDALEQEIVHRAPLFAGRHV
SQLHWGGGTPTYLNKAQISRLMKLLRENFQFNADA
EISIEVDPREIELDVLDHLRAEGFNRLSMGVQDFN
KEVQRLVNREQDEEFIFALLNHAREIGFTSTNIDL
IYGLPKQTPESFAFTLKRVAELNPDRLSVFNYAHL
PTIFAAQRKIKDADLPSPQQKLDILQETIAFLTQS
GYQFIGMDHFARPDDELAVAQREGVLHRNFQGYTT
QGDTDLLGMGVSAISMIGDCYAQNQKELKQYYQQV
DEQGNALWRGIALTRDDCIRRDVIKSLICNFRLDY
APIEKQWDLHFADYFAEDLKLLAPLAKDGLVDVDE
KGIQVTAKGRLLIRNICMCFDTYLRQKARMQQFSRVI
For download: АК последовательность в формате фаста
See also: АК последовательность, SwissProt
|
Общие сведения о белке:
Название гена:
hemN
Название организма:
Escherichia coli, K-12
Индификатор записи банка SwissProt:
HEMN_ECOLI
PDB-код пространственной структуры белка:
1olt
|
Аминокислотный состав Hemn_E.coli
|
Остаток
|
Процентное содержание
|
Остаток
|
Процентное содержание
|
A |
0,079 |
M |
0,018 |
C |
0,020 |
N |
0,037 |
D |
0,074 |
P |
0,037 |
E |
0,059 |
Q |
0,079 |
F |
0,057 |
R |
0,066 |
G |
0,053 |
S |
0,039 |
H |
0,026 |
T |
0,039 |
I |
0,063 |
V |
0,048 |
K |
0,046 |
W |
0,009 |
L |
0,109 |
Y |
0,042 |
|
Процентное содержание аминокислотных остатков в Hemn_E.cloi в сравнении с полным протеомом E.Coli.
Стоит отметить, что, в сравнении с полным протеомом, белок отличается значительно повышенным содержанием Глутамина(Q),
и Аспарагиновой кислоты. Кроме того, наблюдается почти двукратное различие в содержании Цистеина(C) в большую сторону,
и, наоборот, пониженное содержание Триптофана(W) и Валина(V). Всё это даёт возможность делать предположения о функциональной природе белка.
|
Некоторые другие особенности Исходя из pKa боковых групп остатков и последовательности белка, также можно вычислить средний заряд
белковой молекулы при различных pH. Так, при pH=1 средний заряд составит около 62.94, при pH равном 7 и 8, средний заряд белка составляет -8.73 и -13.03 соответсвтенно.
|
Более подробную информацию о проделанной мной работе можно найти здесь(табличные данные и вычисления)
и здесь(краткий отчёт)
|
Пространственная структура>> |
|