Параметр |
Орисание |
Пример использования |
-outfile |
Записывает данные в файл. |
infoseq sw:manb1_bacsu -outfile outfile.txt |
-html |
Результат в формате HTML-таблицы |
infoseq sw:manb1_bacsu -html > html.txt |
-columns |
Для получения информацию о последовательности в виде стройного, выровненного по колонкам файла выходных данных |
infoseq sw:manb1_bacsu -columns > columns.txt |
-delimiter |
Используется для разделения данных в выходном файле |
infoseq sw:manb1_bacsu -delimiter -nocolumns"___" > delimiter.txt |
-only |
Укорачивает выводимую информацию |
infoseq sw:manb1_bacsu -only -name > only.txt |
-heading |
Отображает названия колонок |
infoseq sw:manb1_bacsu -heading -usa -database -name -accession -gi -type -length -pgc -organism -description> heading.txt |
-usa |
Отображает адрес последовательности в банке данных Uniform Sequence Address |
-name |
Отображает название белка |
-accession |
Отображает код доступа |
-type |
Отображает тип белка |
-length |
Отображает длину последовательности в аминокислотных остатках |
-organism |
Отображает название организма |
-description |
Отображает описание белка |
-help |
Выводит информацию о команде infoseq |
infoseq -help 2> help.txt |