|
|||||||||||||||
Нахождение гидрофобных кластеров |
|||||||||||||||
Гидрофобные кластерыС помощью программы CluD в структуре 3bp5 были определены гидрофобные кластеры, представленные на рис. 1.
Рис. 1. Гидрофобные кластеры для 3bp5 при разных начальных параметрах - минимальном числе а.о. в кластере и расстоянии. Видно, что даже при ужесточении условий гидрофобные ядра хоть и уменьшаются, но все равно покрывают всю поверхность белка. Причиной этому служит то, что белок мембранный, и само собой будет практически весь гидрофобным. ДНК-связывающий белок В качестве примера ДНК-связывающего белка был выбран белок 2VW9, которйы связывает одноцепочечную ДНК.
Гидрофобные кластеры представлены на рис. 2.
Рис. 2. Гидрофобные кластеры для 2VW9. Видно, что участки белка формирует гидрофобное ядро для взаимодействия с ДНК. |
|||||||||||||||
|
Просвиров Кирилл. 2013. | Дата последнего изменения: 10 декабря 2016. |