На страницу четвертого семестра


Элементарные эволюционные события



В данном задании нашей задачей является создание схемы минимальных путей превращения кодона TTC, кодирующего аминокислотный остаток фенилаланин в CCG, кодирующий аминокислотнный остаток пролин, не проходящих через стоп-кодоны.

Так как необходимо привести минимальные пути превращения исходного кодона в требуемый, то в цепи превращений должно быть только три стадии замен. Далее, так как замены в позициях можно проводить в произвольном порядке, то количество вариантов будет равно количеству перестановок, то есть 3!=6. Всего 6 цепей превращений:

Исходный кодон Первая стадия Вторая стадия Требуемый кодон
1 TTC
Phe
CTC
Leu
несинонимичная
CCC
Pro
несинонимичная
CCG
Pro
синонимичная
2 TTC
Phe
CTC
Leu
несинонимичная
CTG
Leu
синонимичная
CCG
Pro
несинонимичная
3 TTC
Phe
TCC
Ser
несинонимичная
CCC
Pro
несинонимичная
CCG
Pro
синонимичная
4 TTC
Phe
TCC
Ser
несинонимичная
TCG
Ser
синонимичная
CCG
Pro
несинонимичная
5 TTC
Phe
TTG
Leu
несинонимичная
CTG
Leu
синонимичная
CCG
Pro
несинонимичная
6 TTC
Phe
TTG
Leu
несинонимичная
TCG
Ser
несинонимичная
CCG
Pro
несинонимичная


(коричневым цветом в кодонах выделены позиции, в которых произошли замены).

Как видно, во всех путях происходят только замены цитозина на гуанин, тимина на цитозин, то есть присутствуют как трансверсии, так и транзиции.


©Шахбатян Римма Рубеновна