Прочтение последовательностей по Сэнгеру.

Третий семестр Главный сайт

Прямая последовательность
Обратная последовательность
Выравнивание
Чистая последовательность

Задание 1

Нечитаемые концы:
F: 1-19, 740-924
R: 1-180, 921-948

 
Ложный неопределенный нуклеотид, хотя он вполне очевиден

Отсутствие заметного над шумом сигнала

Шум, принятый за сигнал (на этой же картинке есть верно классифицированный шум на 572)

Двойной пик

Неопределенный нуклеотид, который скорее все-таки можно определить

Хорошо прочитанный участок (обратная цепь)

Сигнал в 3-8 раз сильнее шума, от нуклеотида зависит слабо (гуанин и цитозин в среднем чуть сильнее). Шум возрастает к концу, 
но и до этого есть флюктуации. Кроме того обратная цепь заметно лучше, чем прямая. Меньше неопределяемых нуклеотидов и ровнее сигнал.

Задание 2

Плохая хроматограмма (kamp3_18SIII_F_F03_WSBS-Seq-1-08-15.ab1).
Пики часто неотделимы от шума, накладываются друг на друга или шире нормы.

=======================================================

Сайт находится в стадии разработки