Задание 1. Электронная плотность

Седьмой семестр Главный сайт



1. Изображение электронной плотности вокруг остова полипептидной цепи




Была взята структура 1x0x с базы данных PDB. Это фермент глицерол-3-фосфат дегидрогеназа человека.


Рис. 1. Электронная плотность вокруг остова, уровень подрезки 0,5.



Рис. 2. Электронная плотность вокруг остова, уровень подрезки 1.



Рис. 3. Электронная плотность вокруг остова, уровень подрезки 2.


2. Изображение ЭП вокруг трех различных аминокислотных остатков

Рис. 4. Остаток HIS108, уровень подрезки 0,5. Рис. 5. Остаток HIS108, уровень подрезки 2. Видно, что электронная плотность плохо соответствует радикалу. Рис. 6. Остаток ILE88, уровень подрезки 0,5. Рис. 7. Остаток ILE88, уровень подрезки 2. Рис. 8. Остаток ASN55, уровень подрезки 0,5. Рис. 9. Остаток ASN55, уровень подрезки 2. ==============================================================================================================================================

Сайт находится в стадии разработки


© 2014 Рюмин Константин