Седьмой семестр
Главный сайт
|
Для сравнения был выбран гемоглобин человека.
РСА: 1A3N
ЯМР: 2M6Z, 20 конформеров
Первая
Рис. 1. Наложение структур РСА и ЯМР
Были проанализированы 3 водородных связи:
1. O/ASN9-N/ALA13 в альфа-спирали
2. O/ASP47-ND2/ASN57 в поверхностной петле
3. NH2/ARG104- OD1/ASN139 в ядре белка
Затем строились все водородный связи между соотвествующими атомами в структурах ЯМР и врручную верефицировалось то, что связь не между атомами
разных структур.
Рис. 2. Пример верификации. Видно, что связи от показанной структуры идут не к соотвествующему атому этой структуры, а к атомам других, скрытых
структур.
Итоговая таблица
Видно, что связь в альфа-спирали присутствовала во всех ЯМР-структурах, а связи в петлях из-за подвижности вообще ни в одной.
==============================================================================================================================================
|