Задание 6. Определение вторичной структуры

Использовалась программа Stride и белок глицерол-3-фосфат дегидрогеназа (PDB: 1x0x).

Выдача Stride



Рис. 1. Графическая выдача Stride.

Затем было проведено сравнение элементов вторичной структуры в PDB-файле и выдаче Stride:



Видно, что Stride включает меньше остатков в элементы вторичной структуры. Этот алгоритм строже, чем PDB.



Рис. 2. Спираль, обозначенная в PDB из последней строки таблицы (GLU193-LEU217). Красный, синий и желтый - спирали, найденные Stride.



  Итоговая таблица 


==============================================================================================================================================

Сайт находится в стадии разработки