Седьмой семестр
Главный сайт
|
Для задания был выбран белок глицерол-3-фосфат дегидрогеназа (PDB: 1x0x). Для него искались родственники.
Рис. 1. Найденные родственные белки
Рис. 2. Наложение структур этих белков
Было получено два выравнивания - структурное и множественное по последовательти.
При их анализе было найдено одно место с сильным расхождением. Структурное выравнивание выровняло пролин в один столбец c глицином и глутаматом.
Рис. 3. Расхождение в выравниваниях (структурное выравнивание снизу).
Рис. 4. Остатки, которые проверялись.
Рис. 5. Результаты проверки
Оказалось, что эти остатки не имеют друг к другу отношения и их выравнивание - ошибка, обусловленная попыткой структурного выравнивания петель.
==============================================================================================================================================
|