Занятие 10: ACD ChemSketch

Тринадцатая аминокислота белка CDD_BACSU

Аминокислота аланин и формулы её L- и D-изомеров

Пространственная структура L- и D-форм аминокислоты аланин

L-изомер аланина

D-изомер аланина

Рассмотрим L-форму. Из плоскости, образованной атомами N-Cα-C, выходят атом H и группа CH3. При этом атом водорода направлен на нас (т.е. связь выходит над плоскостью рисунка), группа CH3 - от нас (т.е. связь уходит под плоскость рисунка). У D-формы атом водорода выходит из плоскости от нас, метильная группа - на нас. Таким образом, различие между этими изомерами состоит во взаимном расположении H и CH3. При этом невозможен переход из L-формы в D-форму и наоборот.

Химическая реакция образования дипептида

Реакция образования аспаргиларгинина

Изображение в оригинальном размере.

Пептидная связь — вид амидной связи, возникающей при образовании белков и пептидов в результате взаимодействия α-аминогруппы (—NH2) одной аминокислоты с α-карбоксильной группой (—СООН) другой аминокислоты. Из двух аминокислот (в данном случае, это аспаргин и аргинин) образуется дипептид (цепочка из двух аминокислот) и молекула воды. По этой же схеме генерируются и более длинные цепочки из аминокислот: полипептиды и белки.