Технические характеристики записи 1NZJ
- Разрешение - 1.50 A.
- Число рефлексов - 40227.
- Полнота (процент рефлексов с разрешением ниже указанного) - 96.0.
- R-фактор - 0.147.
- Свободный R-фактор - 0.170, процент рефлексов, использованных для его вычисления - 7.100.
- Кристаллографическая группа и тип симметрии - C 1 2 1
- Длины векторов a, b, c - 115.920, 39.300, 69.150.
- Ортогональны ли базисные периоды - нет (углы 90.00, 116.19, 90.00)
- Совпадает ли абсолютная система координат с депонируемой - да.
- Совпадает ли биологическая единица с ассимметрической единицей, записанной в файле - да
- Есть ли в структуре атомы с коэффициентом заполнения, меньшим 1 - нет.
Вычисление относительных координат одного из Сα-атомов.
Возьмем Сα-атом 7-ого изолейцина:ATOM 30 CA ILE A 7 54.899 -5.988 7.868
Матрица перехода к относительным координатам:SCALE1 0.008627 0.000000 0.004243 0.00000 SCALE2 0.000000 0.025445 0.000000 0.00000 SCALE3 0.000000 0.000000 0.016116 0.00000
Тогда относительные координаты: (0.506998, -0.152365, 0.1268007)асимметрическая и биологическая единицы для записи 2PUC:
PDB-файл с асимметрической единицей PDB-файл с биологической единицей 
Асимметрическая единица не дает почти никакой информации о функционировании белка в клетке: по ней можно судить только о взаимном положении одной цепи белка и одной цепи ДНК. Биологическая же единица дает полное представление о взаимодействии двухцепочечной ДНК с димером белка.