Главная страница > Второй семестр

Мотивы в белке FABI_ECOLI, описанные в БД Prosite

Идентификатор документа PROSITE (AC) Название мотива Краткое описание мотива Тип подписи (паттерн, профиль) Паттерн (регулярное выражение) Специфична ли подпись? Сколько мотивов нашлось в белке?
PS00005 PKC_PHOSPHO_SITE Сайт фосфорилирования протеинкиназой С Паттерн [ST] - x - [RK] Неспецифична 1
PS00009 AMIDATION Сайт образования амидной связи Паттерн x - G - [RK] - [RK] Неспецифична 1
PS00008 MYRISTYL Сайт N-миристоилирования Паттерн G - {EDRKHPFYW} - x(2) - [STAGCN] - {P} Неспецифична 6
PS00007 TYR_PHOSPHO_SITE Сайт фосфорилирования тирозинкиназой Паттерн [RK] - x(2) - [DE] - x(3) - Y или [RK] - x(3) - [DE] - x(2) - Y Неспецифична 1
PS00006 CK2_PHOSPHO_SITE Сайт фосфорилирования казеинкиназой II Паттерн [ST] - x(2) - [DE] Неспецифична 1

Следует отметить, что в данном случае все подписи являются паттернами. Все подписи неспецифичны.
©Сорочкина Александра