Header
Program needle
Rundate Sun Mar 25 2007 18:31:29
Align format srspair
Report file temp_job2.needlep
Results
 
#=======================================
#
# Aligned_sequences: 2
# 1: SYYC_HUMAN
# 2: SYYM_HUMAN
# Matrix: EBLOSUM62
# Gap_penalty: 10.0
# Extend_penalty: 0.5
#
# Length: 335
# Identity:      69/335 (20.6%)
# Similarity:   118/335 (35.2%)
# Gaps:          76/335 (22.7%)
# Score: 69.0
# 
#
#=======================================

SYYC_HUMAN         1 ILKERELKIYWG-TATTGKPHVAYFVPMSKIADFLKAGCEVTILFADLHA     49
                           ..||.| ..|....||.:.:.:..:....:||..|..|.....|
SYYM_HUMAN         1 ------QTIYCGFDPTADSLHVGHLLALLGLFHLQRAGHNVIALVGGATA     44

SYYC_HUMAN        50 YLDNMKA---PWELLEL-RVSYYENVIKAMLESIGVPLEKLKFIKGTD--     93
                     .|.:...   ..|.||. ||......::..||::....::| |..|..  
SYYM_HUMAN        45 RLGDPSGRTKEREALETERVRANARALRLGLEALAANHQQL-FTDGRSWG     93

SYYC_HUMAN        94 ----------YQLSKEYTLDV-------YRLSSVVTQHDSKKAGAEVVKQ    126
                               ||  |::.:|.       :|:.:::    |:::....:|.
SYYM_HUMAN        94 SFTVLDNSAWYQ--KQHLVDFLAAVGGHFRMGTLL----SRQSVQLRLKS    137

SYYC_HUMAN       127 VEHPLLSGLLYPGLQALDEEYL----KVDAQFGGIDQRKIFTFAEKYLPA    172
                     .|...|:...|..|||.|..||    ....|.||.||........:::..
SYYM_HUMAN       138 PEGMSLAEFFYQVLQAYDFYYLFQRYGCRVQLGGSDQLGNIMSGYEFINK    187

SYYC_HUMAN       173 LGYSKRVHLMNPMVPGLTGSKMSSS---------EEESKIDLLD---RKE    210
                     |.......:..|::...||:|:..|         ::.|..:|..   |:.
SYYM_HUMAN       188 LTGEDVFGITVPLITSTTGAKLGKSAGNAVWLNRDKTSPFELYQFFVRQP    237

SYYC_HUMAN       211 D--VKKKLKKAFCEPGNVENNGVLSFIKHVLFPLKSEFVILRDEKWGGNK    258
                     |  |::.||.....|        |..|.|::     :..:...|:.|..|
SYYM_HUMAN       238 DDSVERYLKLFTFLP--------LPEIDHIM-----QLHVKEPERRGPQK    274

SYYC_HUMAN       259 TYTAYVDLEKDFAAEVVHPGDLKNSVEVALNKLL-    292
                     ...|.|       .::||..:..:|.:.....|. 
SYYM_HUMAN       275 RLAAEV-------TKLVHGREGLDSAKRCTQALYH    302


Additional Information