Header
Program needle
Rundate Mon Mar 26 2007 17:42:10
Align format srspair
Report file temp_job1.needlep
Results
 
#=======================================
#
# Aligned_sequences: 2
# 1: SYYC_HUMAN
# 2: SYY_METJA
# Matrix: EBLOSUM62
# Gap_penalty: 10.0
# Extend_penalty: 0.5
#
# Length: 295
# Identity:     108/295 (36.6%)
# Similarity:   170/295 (57.6%)
# Gaps:          25/295 ( 8.5%)
# Score: 455.5
# 
#
#=======================================

SYYC_HUMAN         1 ILKERELKIYWGTATTGKPHVAYFVPMSKIADFLKAGCEVTILFADLHAY     50
                          |...|.|...:||.|:.:::.:.|:.|...||.::.||.||||||
SYY_METJA          1 -----EKSAYIGFEPSGKIHLGHYLQIKKMIDLQNAGFDIIILLADLHAY     45

SYYC_HUMAN        51 LDNMKAPWELLELR-VSYYENVIKAMLESIGVPLEKLKFIKGTDYQLSKE     99
                     | |.|.  ||.|:| :..|.   |.:.|::|:   |.|::.|:::||.|:
SYY_METJA         46 L-NQKG--ELDEIRKIGDYN---KKVFEAMGL---KAKYVYGSEFQLDKD     86

SYYC_HUMAN       100 YTLDVYRLSSVVTQHDSKKAGAEVVKQVEHPLLSGLLYPGLQALDEEYLK    149
                     |||:||||:...|...::::...:.::.|:|.::.::||.:|..|..||.
SYY_METJA         87 YTLNVYRLALKTTLKRARRSMELIAREDENPKVAEVIYPIMQVNDIHYLG    136

SYYC_HUMAN       150 VDAQFGGIDQRKIFTFAEKYLPALGYSKRVHLMNPMVPGLTGSKMSSSEE    199
                     ||...||::||||...|.:.||    .|.|.:.||::.||.|....||.:
SYY_METJA        137 VDVAVGGMEQRKIHMLARELLP----KKVVCIHNPVLTGLDGEGKMSSSK    182

SYYC_HUMAN       200 ESKIDLLDRKEDVKKKLKKAFCEPGNVENNGVLSFIKHVL-FPLKSEFVI    248
                     .:.|.:.|..|:::.|:|||:|..|.||.|.::...|:.| :||    .|
SYY_METJA        183 GNFIAVDDSPEEIRAKIKKAYCPAGVVEGNPIMEIAKYFLEYPL----TI    228

SYYC_HUMAN       249 LRDEKWGGNKTYTAYVDLEKDFAAEVVHPGDLKNSVEVALNKLL-    292
                     .|.||:||:.|..:|.:||..|..:.:||.||||:|...|.|:| 
SYY_METJA        229 KRPEKFGGDLTVNSYEELESLFKNKELHPMDLKNAVAEELIKILE    273


Additional Information