Header
Program needle
Rundate Mon Mar 26 2007 17:55:20
Align format srspair
Report file temp_job3.needlep
Results
 
#=======================================
#
# Aligned_sequences: 2
# 1: SYYM_HUMAN
# 2: SYY_METJA
# Matrix: EBLOSUM62
# Gap_penalty: 10.0
# Extend_penalty: 0.5
#
# Length: 341
# Identity:      73/341 (21.4%)
# Similarity:   125/341 (36.7%)
# Gaps:         107/341 (31.4%)
# Score: 154.0
# 
#
#=======================================

SYYM_HUMAN         1 -QTIYCGFDPTADSLHVGHLLALLGLFHLQRAGHNVIALVGGATARLGDP     49
                      ::.|.||:|:. .:|:||.|.:..:..||.||.::|.|:....|.|...
SYY_METJA          1 EKSAYIGFEPSG-KIHLGHYLQIKKMIDLQNAGFDIIILLADLHAYLNQK     49

SYYM_HUMAN        50 SGRTKEREALETERVRANARALRLGLEALAANHQQLFTDGRSWGSFTVLD     99
                     .         |.:.:|......:...||:....:.::      ||...||
SYY_METJA         50 G---------ELDEIRKIGDYNKKVFEAMGLKAKYVY------GSEFQLD     84

SYYM_HUMAN       100 NSAWYQKQHLVDFLAAVGGHFRMG--TLL--SRQSVQLRLKSPEGMSLAE    145
                     .          |:...|   :|:.  |.|  :|:|::|..:..|...:||
SYY_METJA         85 K----------DYTLNV---YRLALKTTLKRARRSMELIAREDENPKVAE    121

SYYM_HUMAN       146 FFYQVLQAYDFYYLFQRYGCRVQLGGSDQLGNIMSGYEFINKLTGEDVFG    195
                     ..|.::|..|.:||    |..|.:||.:|....|...|.:.|    .|..
SYY_METJA        122 VIYPIMQVNDIHYL----GVDVAVGGMEQRKIHMLARELLPK----KVVC    163

SYYM_HUMAN       196 ITVPLITSTTG-AKLGKSAGNAVWLNRDKTSP------------------    226
                     |..|::|...| .|:..|.||.:.::   .||                  
SYY_METJA        164 IHNPVLTGLDGEGKMSSSKGNFIAVD---DSPEEIRAKIKKAYCPAGVVE    210

SYYM_HUMAN       227 ----FELYQFFVRQP-----------DDSVERYLKLFTFLPLPEIDHIMQ    261
                         .|:.::|:..|           |.:|..|.:|.:.....|: |.|.
SYY_METJA        211 GNPIMEIAKYFLEYPLTIKRPEKFGGDLTVNSYEELESLFKNKEL-HPMD    259

SYYM_HUMAN       262 LHVKEPERRGPQKRLAAEVTKLVHGREGLDSAKRCTQALYH    302
                     |          :..:|.|:.|::.                 
SYY_METJA        260 L----------KNAVAEELIKILE-----------------    273


Additional Information