Учебный сайт Юдиной А.С.

Главная

Обо мне

Семестры

Краткое описание Chitin-binding protein и его геномного кружения

Аминокислотная последовательность белка: 

>ALU92050.1 chitin-binding protein
MHAKRKTALAVGAVLAPVLALSLPASSASAHGYISNPPSRQAQCAAGTVSCGSITYEPQS
VEGPKGLTSCSGGNSGFAELDDDSKGWAVTPVNRSQQFEWKLTARHSTSTWQYFVGGEKI
AEFDDGGAQPGATVTHQVDFGNKTGQQKVLAVWNIADTSNAFYACIDVNVS

Таблица 1. Описание хитин-связывающего белка из генома бактерии Streptomyces globisporus C-1027.

Параметр Значение
Идентификатор белка ALU92050.1
Идентификатор фрагмента генома CP013738.1
Координаты гена в геноме 217879..218394
Длина гена (п.н.) 516
Цепь Обратная
Длина белка (в аминокислотных остатках) 171

Геномное окружение Chitin-binding protein:

Нуклеотидная последовательность для данного белка считывается с комплиментарной цепи, рамка считывания -1. Как видно из окружения, перекрвания с другими генами не происходит. Стартовый кодон - AUG, соответствует Met; стоп-кодон - TAG.

© Юдина Анастасия, 2016