Neisseria gonorrhoeae

Описание генома бактерии Neisseria gonorrhoeae, штамм FA 1090

Neisseria gonorrhoeae принадлежит домену бактерий, род Neisseria, вид Neisseria gonorrhoeae, штамм FA 1090. Является возбудителем антропонозной венерической инфекции, характеризующейся гнойным воспалением слизистых оболочек, чаще мочеполовой системы (гонореи) [1].

Геном бактерии Neisseria gonorrhoeae, штамм FA 1090, состоит из одной двухцепочечной кольцевой молекулы ДНК. Он описан в записи NC_002946 базы данных RefSeq. Длина генома - 2153922 пар нуклеотидов. В записи приведена последовательность одной из двух комплементарных цепей ДНК.

По данным из записи NC_002946, в геноме закодировано 2069 генов. Из них 2002 кодируют белки, остальные 67 кодируют РНК. Псевдогенов нет.

Описание оперона АТФ-синтазы в геноме Neisseria gonorrhoeae, штамм FA 1090

АТФ-синтаза – белок, состоящий из нескольких субъединиц. Главная функция АТФ-синтазы состоит в синтезе АТФ – молекул, аккумулирующих энергию в клетке. У Neisseria gonorrhoeae АТФ синтаза типа F. α-субъединица АТФ-синтазы закодирована на прямой цепи (см. рис.1, ген α-субъединицы АТФ-синтазы обозначен как NGO2148).

Рис.1. Окрестность гена NGO2148 в геноме Neisseria gonorrhoeae штамм FA 1090. Рисунок получен с помощью геномного браузера на сайте NCBI (http://www.ncbi.nlm.nih.gov)

На рис.1 отображены все гены, которые, возможно, входят в один оперон с геном NGO2148. Возможный оперон включает в себя 9 генов, продукты которых описаны как компоненты АТФ синтазы. Все гены предполагаемого оперона описаны в таблице 1.

Таблица 1. Гены, предположительно, входящие в оперон АТФ синтазы вместе с геном NGO2148. Предыдущий ген расположен на обратной цепи (т.е. в ориентации -1), а следующий имеет продукт, не связанный с АТФ синтазой, в таблицу эти гены не включены.
№ гена Координата начала гена в геноме Координата конца гена в геноме Идентификатор кодируемого белка Продукт гена по данным NCBI Перевод названия продукта на русский язык
1 2121443 2121796 YP_209152.1 ATP synthase I АТФ синтаза I
2 2121786 2122652 YP_209153.1 ATP synthase F0F1 subunit A А-субъединица АТФ синтазы
3 2122709 2122945 YP_209154.1 ATP synthase F0F1 subunit C С-субъединица АТФ синтазы
4 2123015 2123485 YP_209155.1 ATP synthase F0F1 subunit B В-субъединица АТФ синтазы
5 2123490 2124023 YP_209156.1 ATP synthase F0F1 subunit delta δ-субъединица АТФ синтазы
6 2124034 2125581 YP_209157.1 ATP synthase F0F1 subunit alpha α-субъединица АТФ синтазы
7 2125606 2126481 YP_209158.1 ATP synthase F0F1 subunit gamma γ-субъединица АТФ синтазы
8 2126519 2127916 YP_209159.1 ATP synthase F0F1 subunit beta β-субъединица АТФ синтазы
9 2127927 2128349 YP_209160.1 ATP synthase F0F1 subunit epsilon ε-субъединица АТФ синтазы

Таким образом, АТФ синтаза Neisseria gonorrhoeae предположительно состоит из 9 различных субъединиц.

Ссылки

[1] Neisseria gonorrhoeae. Wikipedia

© Маслова Валентина, 2013
Последнее изменение: 21.12.2013