Использование сервисов PDB

Для демонтрации возможностей advanced search в базе данных PDB был сформиован запрос следующео вида:

  • Метод разрешения структуры: RSA
  • Значение разрешения: не хуже, чем 2Å
  • По классификации ферментов: 3.1.8.* - phosphoric triester hydrolases

По данному запросу находится 70 структур. .fasta-файл, содержащий последовательности данных белков можно скачать по ссылке.

Полная таблица с результатами поиска доступна по ссылке. Дополнительно в таблицу результатов внесена информация касательно того, какие функции эти белки могут выполнять в клетке и с какими лигандами они могут связываться.

Структуры, удовлетворяющие запросу, доступны по ссылке.

© Маслова Валентина, 2014
Последнее изменение: 24.09.2014