Ищем выравнивание

Просто взяла выравнивание из прошлого практикума.

Приводим в порядок

Remove redundancy на 90 не показал лишних последовательностей, поэтому всё оставила (в итоге 8 последовательностей). Далее убрала колонки гэпов и сделала Sort by pairwise identity.

Блоки

Я выделила 5 блоков с наибольшей плотностью консервативных позиций (на мой взгляд). Их длина составила от 6 до 13 аминокислот. При этом блоки 1 и 2 расположены близко друг к другу; между 3, 4 и 5 расстояние больше, но соизмеримо с их длинами. На основании наличия этих пяти консервативных блоков, образующих два участка объединения, можно говорить о гомологичности последовательностей, представленных в выравнивании.
Увидеть результат работы можно на Рисунке 1. Решила выделить сами участки в последовательности - мне так показалось нагляднее. Строка в аннотациях тоже есть.

Ссылка на проект.