Геномные браузеры

1. UCSC

Имя: ADH7 (alcohol dehydrogenase 7)
Gencode Gene: ENSG00000196344.11
Strand: -
Хромосома: chr4
Плечо и полоса: q23
Координаты: 99,412,261 - 99,435,737
Альтернативные продукты в гене: 4

**Табл. 1.** Информация о закодированных продуктах.
транскрипты	число экзонов	длина аминокислотной последовательности
ENST00000482593.5	10 (7 кодирующих)	317
ENST00000437033.6	9	374
ENST00000209665.8	9	386

картинка — **Рис. 1.** Окрестность гена из Genome Browser.

2. Ensembl

Выравнивание

Команда для infoalign:

 infoalign -sequence Hum_Chimp.msf -only -change -outfile stdout

Сохранила выравнивание в формате .msf, следуя указанию из задания. Для подсчета процента различий пользовалась командой выше. Получила 1.918986. Если верить информации из интернета, различия в геномах человека и шимпанзе могут достигать 4%, следовательно, полученный результат правдоподобен.