Филогенетические деревья

Табл. 1. Отобранные бактерии.
Название бактерии Мнемоника
Bacillus subtilis BACSU
Clostridium botulinum CLOBA
Lactobacillus acidophilus LACAC
Listeria monocytogenes serovar 1/2a LISMO
Moorella thermoacetica MOOTA
Staphylococcus aureus STAAR
Streptococcus pneumoniae serotype 4 STRPN

Скобочная формула дерева

((MOOTA, CLOBA), ((STAAR, (LISMO, BACSU)), (STRPN, LACAC)));

Изображение дерева

Дерево
Рис. 1. Филогенетическое дерево некоторых бактерий из фирмикут.

Ветви дерева

5 нетривиальных ветвей:

1){STRPN, LACAC} VS {STAAR, LISMO, BACSU, MOOTA, CLOBA}
2){STRPN, LACAC, STAAR} VS {LISMO, BACSU, MOOTA, CLOBA}
3){STAAR, LISMO, BACSU} VS {STRPN, LACAC, MOOTA, CLOBA}
4){LISMO, BACSU} VS {STRPN, LACAC, STAAR, MOOTA, CLOBA}
5){STRPN, LACAC, STAAR, LISMO, BACSU} VS {MOOTA, CLOBA}

Задание 1 из практикума 2

Ветвь {STAAR, LISMO, BACSU} отвечает таксону Bacillales;
{STRPN, LACAC} - Lactobacillales;
{STRPN, LACAC, STAAR, LISMO, BACSU} - Bacilli;
{MOOTA, CLOBA} - Clostridia.