Таблица параметров водородных связей |
|||
# |
Имена атомов |
Длина связи,Å |
Угол N-Н-О,° |
Альфа-спирали |
|||
1 |
N(206LEU)- O(202ILE):a |
2.21 |
158.0 |
2 |
N(203GLU)- O(199THR):a |
2.11 |
164.1 |
3 |
N(199THR)- O(195THR):a |
1.99 |
167.6 |
β-тяжи |
|||
1 |
N(241ILE)- O(229LYS):a |
2.18 |
160.7 |
2 |
N(229LYS)- O(241ILE):a |
1.98 |
157.1 |
3 |
N(243PHE)- O(227GLY):a |
2.11 |
158.4 |
Среднее расстояние между атомами атомами азота и кислорода в α-спирали равно 2.01Å, в β-листе - 2.09Å. Теоретическое значение длины связи в α-спирали равно 2.99Å, в β-листе - 2.91Å. Значения уголов N-H-O теоретически должны находиться в районе 180° ± 45°. На практике среднее значение в α-спирали равно 163°, в β-листе - 159°. Таким образом, углы водородных связей согласуются со стандартными, а длины связей в исследованных структурах заметно короче.
https://www.rcsb.org/structure/5f82
Baker, E. N. & Hubbard, R. E. (1984). Hydrogen bonding
in globular proteins. Progr. Biophys. Mol. Biol. 44, 97-179
D. F. Stickle et al. Hydrogen Bonding in Globular Proteins
proteinstructures.com