Скачать таблицу. Выравнивания гомологичных и негомологичных белков отличаются по параметру Score, среднее значение которого для гомологичных белков составляет 409,5 и 39,65 для негомологичных соответственно (разница большая и тенденция сохраняеся как для глобальных, так и для локальных выравниваний). Количество гэпов, ожидаемо, больше всего в глобальном выравнивании негомологичных белков, но вот в локальных выравниваниях их же не очень много ( в среднем 27,8). Также интересно, что локальные выравнивания негомологичных белков показали достаточно высокие проценты сходства (но все же значительно ниже, чем даже в глобальных гомологичных), доходящие до 40,3 процентов.
Скачать проект множественного выравнивания.
Сравнение глобального, локального и множественного выравниваний (представлены в этом порядке).
Отличия выравниваний:
1) В парных выравниваниях гэп стоит напротив аминокислоты на 54 позиции, а во множественном смещён на одну позицию влево.
2) В парных выравниваниях между 229 и 232 позициями стоят два гэпа (в глобальном), во множественном они смещены на одну аминокислоту вправо.
3) В парных выравниваниях гэпы стоят после аминокислоты, стоящей на 240 позиции глобального выравнивания. Во множественном гэпы стоят до неё.