Страница десятого практикума

elongation factor for RNA polymerase II 2
Имя гена (короткое): ELL2
Идентификатор гена в Gencode: ENSG00000118985.16
Цепь: -
Хромосома:chr5
К каким плечу и полосе принадлежит участок: chr5:q15
Альтернативные продукты (транскрипты): 0

Идентификатор Gencode Координаты в хромосоме Число экзонов Длина последовательности белка
ENST00000237853.9 95,885,098-95,961,851 12 640

g

Выравнивание гена человека и шимпанзе, полученное с Ensemble
Информация о выравнивании, полученная с помощью infoalign
Считаем процент различий. 492/76961=0,64%
Авторы статьи утверждают, что среднее различие по геному для человека и шимпанзе составляет 1,23%.
Если брать за точку отсчета это значение, то можно сказать, что данный участок является консервативным. Но валидность сравнения консервативности только кодирующего участка и всего гненома, конечно, маловероятна.