Параметры водородных связей между остовными атомами во вторичной структуре
| # | Имена атомов | Длина связи (Ангстрем) | Угол N-O-C (°) |
|---|---|---|---|
| Альфа-спирали | |||
| 1 | N(165GLN)-O(162ASP) | 2.64 | 161.5 |
| 2 | N(224ALA)-O(220SER) | 3.04 | 148.3 |
| 3 | N(162ASP)-O(158GLN) | 2.95 | 160.5 |
| Бета-тяжи | |||
| 1 | N(146VAL)-O(118LEU) | 2.8 | 150.6 |
| 2 | N(209TRP)-O(194TUR) | 2.99 | 168.8 |
| 3 | N(067HIS)-O(060ILE) | 2.89 | 158.8 |
Средняя длина водородной связи в a-спирали 2.88 Ангстрем, в b-тяжах 2.89 Ангстрем, что не превышает максимальной возможной длины водородной связи - 3.5 Ангстрем. Максимальное отклонение значения угла N-O-C от идеального составило 31.7°, что тоже в пределах нормы. Среднее отклонение - 21.9°.
© Антоненкова Юлия, 2017