| UniProt ID | UniProt AC | RefSeq ID | PDB ID | длина | молярная масса | название |
|---|---|---|---|---|---|---|
| RIFK_AMYMS | O52552 | WP_013222557.1. NC_018266.1. |
1B9I 1B9H |
388 а.о. | 42211 | Full = 3-amino-5-hydroxybenzoate synthase Short = AHBA synthase |
Рассматриваемый белок - фермент 3-амино-5-гидроксибензоатсинтаза.
Этот фермент катализирует реакции дегидратации и ароматизации 3-амино-5-деокси-3-дегидрошикимат(aminoDHS)
с превращением его в 3-амино-5-гидроксибензоат (AHBA).
Оптимальные условия функционирования: pH = 7.5, температура - 33 по Цельсию.
Имеет лиазную и трансферазную активность.
В качестве кофермента выступает пиридоксальфосфат.
| Кластер | ID кластера | Количество белков в кластере | Описание кластера | Замечания |
|---|---|---|---|---|
| UniRef100 | UniRef100_O52552 | 3 | Идентичные последовательности | Варианты фермента организмов разных штаммов одного и того же вида |
| UniRef90 | UniRef90_O52552 | 9 | Записи идентичны min на 90%, на 80% перекрываются с самой длинной последовательностью в кластере | Все организмы принадлежат одному роду - Amycolatopsis |
| UniRef50 | UniRef50_O52552 | 213 | Записи идентичны min на 90%, на 80% перекрываются с самой длинной последовательностью в кластере | Все организмы принадлежат одному порядку - Actinomycetales |
| Критерий поиска | Текст запроса | Количество найденных белков | Количество найденных белков из раздела Reviewed | Замечания | |
|---|---|---|---|---|---|
| Короткое название | name:"ahba synthase" | 146 | 3 | ||
| По короткому названию среди белков своего организма | name:"ahba synthase" organism:"amycolatopsis mediterranei strain s699" | 1 | 1 | ||
| По короткому названию среди белков из организмов того же семейства (family) | name:"ahba synthase" taxonomy:pseudonocardiaceae | 6 | 1 | ||
| По короткому названию среди белков из организмов того же отдела (phylum) | name:"ahba synthase" taxonomy:actinobacteria | 115 | 3 | ||
| По названию Actin без ограничений на организм | name:actin | 66779 | 1138 | ||
| По названию Actin в таксоне Ciliophora (Инфузории) | name:actin taxonomy:ciliophora | 317 | 11 | ||
| По названию Actin в таксоне Viridiplantae (Зелёные растения) | name:actin taxonomy:viridiplantae | 5091 | 152 | ||
| По названию Trypsin | name:trypsin | 18951 | 311 | ||
| Из результатов по названию Trypsin выбрать результаты по названию Inhibitor | name:trypsin name:inhibitor | 3914 | 210 | ||
| По названию Trypsin inhibitor | name:"trypsin inhibitor" | 3754 | 198 | ||
| Из результатов по названию "trypsin" выбрать результаты по названию "inhibitor", а затем исключить результаты поиска по "trypsin inhibitor" | name:trypsin name:inhibitor NOT name:"trypsin inhibitor" | 160 | 12 | Более точный поиск был произведен по запросу "trypsin" and "inhibitor", чем по запросу "trypsine inhibitor" |
© Антоненкова Юлия, 2017