О себе | I семестр | II семестр | Сайт ФББ



EMBOSS и протеомы

Таблица 1.
Proteome IDКоличество последовательностей Количество аминокислот в последовательностях
UP00000613895513046683
UP00000062543138109780
Таблица 2.
Аминокислотные остатки Процент остатка в протеоме AMYMS Процент остатка в протеоме ECOLI Разность
A 13,76 11,44 2,32
L 10,51 12,84 -2,33
G 9,46 8,86 0,60
V 8,81 8,51 0,30
R 7,70 6,64 1,06
T 6,16 6,49 -0,33
P 6,03 5,33 0,70
D 5,89 6,19 -0,30
E 5,44 6,93 -1,50
S 4,98 6,97 -1,99
I 3,31 7,23 -3,92
F 3,00 4,68 -1,69
Q 2,74 5,34 -2,60
H 2,21 2,73 -0,52
K 2,17 5,30 -3,13
Y 2,06 3,42 -1,36
N 1,92 4,73 -2,81
M 1,57 3,39 -1,83
W 1,55 1,84 -0,29
C 0,75 1,40 -0,64
U 0,00 0,00 0,00

Excel таблица

Самые часто встречающиеся аминокислоты: A и L для организма AMYMS, L и A для ECOLI Далее идут: G, V, R, потом T, P, D, E, S. Самое большое значение разности - 3.92% для I.






© Антоненкова Юлия, 2017