О себе | I семестр | II семестр | III семестр | Сайт ФББ

Геномные браузеры

UCSC genome browser

Полное имя: V-type proton ATPase subunit E 1
Короткое имя: V-ATPase subunit E 1
Цепь: -
Хромосома: 22
Плечо и полоса, к которым принадлежит участок: chr22:q11.21 (большое плечо)
Координаты гена в последовательности хромосомы: hg38 chr22:17,592,674-17,628,635
Количество альтернативных продуктов: 1 
Длина продукта: 196 а.к. остатка
Количество экзонов для продукта: 8

Окрестность гена из Genome Browser.

Ensembl

Выравнивание двух гомологичных белков человека и шимпанзе
Результат работы команды distmat:

	    1	    2
	  0.00	  1.46		homo_sapiens_1-36882 1
		  0.00		pan_troglodytes_1-36882 2

Количество SNP с Global MAF >= 0.001 (этим условием отсекаем редко встречающиеся полиморфизмы: показатель Global MAF - частота второго по распространенности в популяции аллеля) - 517. Длина выравнивания 36882, то есть частота полиморфизмов - 1.40 штук на 100 нуклеотидов, что чуть меньше, чем различия человека и шимпанзе, значит, люди отличаются друг от друга чуть меньше, чем от шимпанзе.