О себе | 1 семестр | 2 семестр | 3 семестр | 4 семестр | Сайт ФББ



Филогенетическое дерево

НазваниеМнемоникаClass; order; family; genus
Paracoccus denitrificansPARDP Alphaproteobacteria; Rhodobacterales; Rhodobacteraceae; Paracoccus
Bartonella henselaeBARHE Alphaproteobacteria; Rhizobiales; Bartonellaceae; Bartonella
Rhizobium meliloti
(Sinorhizobium meliloti)
RHIME Alphaproteobacteria; Rhizobiales; Rhizobiaceae; Sinorhizobium/Ensifer group; Sinorhizobium
Bordetella pertussisBORPE Betaproteobacteria; Burkholderiales; Alcaligenaceae; Bordetella
Escherichia coliECOLI Gammaproteobacteria; Enterobacterales; Enterobacteriaceae; Escherichia
Serratia proteamaculansSERP5 Gammaproteobacteria; Enterobacterales; Yersiniaceae; Serratia
Saccharophagus degradansSACD2 Gammaproteobacteria; Cellvibrionales; Cellvibrionaceae; Saccharophagus
Pseudomonas mendocinaPSEMY Gammaproteobacteria; Pseudomonadales; Pseudomonadaceae; Pseudomonas; Pseudomonas aeruginosa group


Все рассматриваемые виды относятся к типу (phylum) Proteobacteria.





Скобочная формула дерева:
((((SERP5, ECOLI), (SACD2, PSEMY)), BORPE), (PARDP, (BARHE, RHIME))); 


Список нетривиальных ветвей дерева и таксоны, которые они выделяют:
1) {SERP5, ECOLI} против {SACD2, PSEMY, BORPE, PARDP, BARHE, RHIME} - Gammaproteobacteria; Enterobacterales
2) {SACD2, PSEMY} против {SERP5, ECOLI, BORPE, PARDP, BARHE, RHIME} - Gammaproteobacteria, кроме Enterobacterales
3) {SERP5, ECOLI, SACD2, PSEMY} против {BORPE, PARDP, BARHE, RHIME} - Все Gammaproteobacteria
4) {SERP5, ECOLI, SACD2, PSEMY, BORPE} против {PARDP, BARHE, RHIME} - Все Alphaproteobacteria
5) {SERP5, ECOLI, SACD2, PSEMY, BORPE, PARDP} против {BARHE, RHIME} - Alphaproteobacteria; Rhizobiales








© Антоненкова Юлия, 2017