Выбранный белок: AC: P0AD49 Name: Ribosome-associated inhibitor A Organism: Escherichia coli K-12 Prevents 70S dimer formation, probably in order to regulate translation efficiency during transition between the exponential and the stationary phases.
Номер итерации | Число находок выше порога (0,005) | Идентификатор худшей находки выше порога | E-value этой находки | Идентификатор лучшей находки ниже порога | E-value этой находки |
1 | 22 | Q49VV1.1 | 8e-04 | P19954.2 | 0.022 |
2 | 27 | O05886.4 | 3e-09 | Q82IY7.1 | 0.092 |
3 | 27 | O05886.4 | 2e-24 | Q82IY7.1 | 0.080 |
4 | 27 | P24694.1 | 1e-24 | Q82IY7.1 | 0.17 |
5 | 27 | P24694.1 | 3e-24 | O58050.1 | 0.19 |
6 | 27 | P24694.1 | 2e-24 | Q9LIM6.1 | 0.48 |
7 | 27 | P24694.1 | 2e-24 | Q9LIM6.1 | 0.44 |
8 | 27 | P24694.1 | 2e-24 | Q9LIM6.1 | 0.44 |
Результаты поиска программой PSI-BLAST начали сходиться уже на 5 - 7 итерациях, при этом разница между e-value худшей находки выше порога и лучшей находки ниже порога сильно различаются, начиная с 3 итерации, что означает, что с большой вероятностью находки составляют семейство гомологичных белков.
© Антоненкова Юлия, 2017