О себе | I семестр | II семестр | Сайт ФББ



PSI-BLAST

Выбранный белок:
AC: P0AD49
Name: Ribosome-associated inhibitor A
Organism: Escherichia coli K-12

Prevents 70S dimer formation, probably in order to 
regulate translation efficiency during transition 
between the exponential and the stationary phases.

Таблица итераций
Номер итерации Число находок выше порога (0,005) Идентификатор худшей находки выше порога E-value этой находки Идентификатор лучшей находки ниже порога E-value этой находки
1 22 Q49VV1.1 8e-04 P19954.2 0.022
2 27 O05886.4 3e-09 Q82IY7.1 0.092
3 27 O05886.4 2e-24 Q82IY7.1 0.080
4 27 P24694.1 1e-24 Q82IY7.1 0.17
5 27 P24694.1 3e-24 O58050.1 0.19
6 27 P24694.1 2e-24 Q9LIM6.1 0.48
7 27 P24694.1 2e-24 Q9LIM6.1 0.44
8 27 P24694.1 2e-24 Q9LIM6.1 0.44


Результаты поиска программой PSI-BLAST начали сходиться уже на 5 - 7 итерациях, при этом разница между e-value худшей находки выше порога и лучшей находки ниже порога сильно различаются, начиная с 3 итерации, что означает, что с большой вероятностью находки составляют семейство гомологичных белков.






© Антоненкова Юлия, 2017