описание вируса Mopeia | Марина Хачатурян

Описание генома Mopeia virus

Mopeia virus – древний вид ареновирусов (arenaviruses). По типу носителя генома классифицируется как ssRNA negative-strand virus, т.е. носителем информации является одноцепочечная РНК негативной полярности (т. е. транслируется комплементарная РНК).

Геном был выделен группой ученых из штамма из Республики Мозамбик. Он состоит из одной молекулы РНК (сегмент L), длина которого составляет 7242 (здесь и далее длины измеряются в парах нуклеотидов, если не указано другого). В геноме закодировано два гена, данные о которых приведены в таблице 1.

Таблица 1. Гены в геноме Mopeia virus

№	Сегмент	Начало	Конец	Ориентация	Длина	Продукт
1	L	81	392	1	312	Z protein
2	L	498	7187	-1	6690	L protein

Графическое изображение из базы приведено на рис. 1. На нем мы можем видеть, что гены не пересекаются. Длина каждого гена делится на 3, как это и должно быть.

Рис. 1. Расположение генов в сегменте L Mopeia virus (идентификатор: DQ328875.1). Рисунок получен с помощью геномного браузера на сайте NCBI

Рис. 2. Участок начала гена L Mopeia virus. Рисунок получен с помощью геномного браузера на сайте NCBI

На рис. 2 мы видим конечный участок гена L со стоп-кодоном TAG.