|
|
Описание mandelate racemase/muconate lactonizing family protein из генома бактерии Cytophaga hutchinsonii, штамм ATCC 33406.
Информация о белке и его гене, полученная из записи NC_008255.1
базы данных RefSeq с полным геномом бактерии, приведена в таблице 1. На рис. 1
изображена окрестность в геноме гена описываемого белка.
Таблица 1. Информация о mandelate racemase/muconate lactonizing family protein (идентификатор YP_678745.1 в базе RefSeq)
| Вид информации |
Квалификатор в записи генома |
Значение |
| Локус гена в геноме |
/locus_tag |
CHU_2140 |
| Имя гена |
/gene |
tfdD |
| Идентификатор гена в базе данных NCBI Gene |
/db_xref=”GeneID:…” |
4187064 |
| Начало гена в геноме |
-- |
2486267 |
| Конец гена в геноме |
-- |
2487373 |
| На какой цепи кодируется ген (прямая или обратная) |
-- |
обратная |
| Длина гена |
-- |
1107 |
| Идентификатор белка в базе данных NCBI Protein |
/protein_id |
YP_678745.1 |
| Длина белка (в аминокислотных остатках) |
-- |
368 |
.jpg)
| Рис. 1.Геномная окрестность гена mandelate racemase/muconate lactonizing family protein.
Ген отмечен черной рамочкой. Рисунок получен с помощью геномного браузера на сайте NCBI |
Можно предположить, что четыре гена, находящиеся со стороны 5'-конца от гена tfdD, составляют с ним оперон,
но это маловероятно, так как расстояние до ближайшего гена (280 пар нукдеотидов) достаточно большое.
|
|
|