|
|
Гидрофобные группы атомов в белке.
Рис. 1. Гидрофобные атомы
|
Воспользовавшись предложенным скриптом, я выделила все гидрофобные структуры (рис. 1.) моего
белка. Они играют важную роль в образовании третичной структуры белка. В скрипте гидрофобные
атомы определяются как все атомы S или C, не взаимодействующие с полярными атомами. Такие атомы
есть во всех аминокислотах, кроме глицина и серина.
|
Рис. 2. Цепь А.
|
В моем белке гидрофобных групп очень много и они распределены равномерно, поэтому выделить
какой-либо отдельный кластер трудно. На рис. 2 я для наглядности привела отдельно цепь А.
|
|