|
Изучение файла структурных факторов
Структурные факторы, полученные в РСА, храняться в специальном
файле
в формате mmCIF. Загрузить его можно с сайта PDB,
что и было сделано для структуры 3Q4D (моего белка). На основе этого файла была сделана
таблица, содержащая значения средних измерений структурных
факторов и стандартных отклонений для всех измереннных троек (h,k,l), и прибавлен еще один столбец -- сила сигнала.
В столбце "status" содержится информация о том, использовалась ли эта тройка (h,k,l) для оптимизации модели "o" или
для контроля "f". Еще в этой колонке может стоять "x" для "пропущенных" троек, для которых нет данных измерений, но
есть рассчитанные факторы и фазы. По данным из заголовка файла структурных факторов h ∈ [-32;32], k ∈ [0;54],
l ∈ [0;62]. Приведу пример нескольких "пропущенных" троек: (-28,0,1), (0,5,1), (2,0,2), (1,0,4), (-10,40,5)
и другие.
Всего в файле записаны данные о 116941 тройке, из которых 346 имеют статус "x", 110765 имеют статус "o" и 5830 имеют статус
"f". 114874 структурных факторов из 116595 (98.5%) имеют силу сигнала не менее 3.
|