|
|
|
- Создайте директорию Practice12, а в ней поддиректорию Images, в которой
Вы будете хранить необходимые рисунки.
-
Создайте заготовку (шаблон) web-странички по данному Вам образцу.
В редакторе Far Manager создайте файл template.html. Наберите текст,
приведенный в образце.
Не забывайте, что кодировка должны быть "Win"!
Откройте файл в Internet Explorer, посмотрите, что получилось.
Образец специально создан так, чтобы Вам захотелось его отредактировать.
Подберите цвета фона странички (bgcolor), основного шрифта (text)
странички и горизонтальной линии (HR), используя код RGB.
Подберите размер горизонтальной линии (аттрибут size).
Впишите вместо слов "Фамилия, Имя" свои фамилию и имя.
Откройте файл посредством Internet Explorer. Если страница выглядит
неудовлетворительно, подредактируйте файл.
При выборе цвета и размера имейте в виду, что оформление всех
страничек Вашего сайта должно быть выдержано в едином стиле.
При создании каждой следующей странички копируйте эту заготовку
в файл с новым именем.
-
Создайте страничку с изображением Вашего трипептида (tripeptide.html).
Названием страницы (<TITLE>) сделайте название программы: ACD/ChemSketch.
Заголовок текста "русское" название трипептида (выравнивание
по центру).
Правило: стандартное название пептида составляется из названий входящих
в него аминокислот, перечисляемых, начиная с N-конца, причем во всех
названиях, кроме последнего, суффикс "-ин" меняется на "-ил",
например, трипептид WRA называется триптофаниларгинилаланин, см. подробнее
словарик.
Создайте таблицу с невидимыми границами, из одной строки и двух
столбцов. В левую ячейку поместите изображение структурной формулы
Вашего трипептида, а в правую необходимые подписи, например: "Это
первые (последние, …) аминокислотные остатки белка………" или "Красным
цветом выделено….".
Подсказка: Вам нужно создать отдельный графический
файл (.gif). Выделите нужный рисунок в отчете за второй блок. Скопируйте
его в буфер, откройте программу Paint (Programs → Accessories
→ Paint), вставьте рисунок (<Ctrl+V> или Edit → Paste)
и сохраните его в файле xxx.gif директории Images с помощью кнопок
File → Save as.
В левую ячейку таблицы поместите <IMG src="Images/xxx.gif">.
Совет: подберите оптимальные размеры рисунков, используя атрибуты
width и height тега <IMG>.
-
Создайте страничку с описанием общих характеристик белка по данным
Вашего отчета за первый блок
Название страницы XXXX_ECOLI (краткое название Вашего белка).
Заголовок текста полное русское название белка, а в скобках полное
английское (заголовок выровнен по центру).
Совет: не стесняйтесь спросить преподавателя, как называется
Ваш белок по-русски.
Далее поместите текст, оформленный как список:
- Краткое название белка: XXXX_ECOLI
- Полное название организма: Escherichia coli, K-12
- Название гена: xxxX.
- Номер локуса в бактериальной хромосоме: x00000
- Последовательность в формате FASTA (преформатированный текст,
который лучше к тому же поместить в прямоугольник с чуть отличающимся
фоном; как изготовить такой прямоугольник, попробуйте сообразить
сами!)
Далее поместите заголовок "Мои вычисления с помощью Excel".
Совет: этот заголовок должен быть более низкого уровня по отношению
к заголовку страницы.
Далее поместите таблицу, состоящую из одной строки и двух столбцов.
В левую ячейку поместите заголовок "Aминокислотный состав" и таблицу
с аминокислотным составом, а в правую текст следующего вида:
Длина последовательности: 999 а.о.
Молярная масса: 100000 г/моль.
Средний заряд молекулы:
при рН=7,0: +(или )0,00,
при рН=1,0: +(или )100,00
Отношение содержания гидрофобных остатков (список) к содержанию гидрофильных
(список): ……; это позволяет думать, что данный белок является (или
не является) мембранным.
Совет: Вам нужно создать вложенную таблицу вида:
Аминокислотный состав |
А (аланин) |
10,2% |
С (цистеин) |
0,5% |
Удобнее всего написать аккуратно теги для первых двух строк, проверить
их, затем путем копирования создать таблицу нужного размера, и только
потом внести в нее нужную Вам информацию, заменяя числа и названия а.о.
Как красиво написать минус (10, а не -10), см. в подсказках.
-
Создайте страничку 3D.html с общим описанием 3D-структуры Вашего
белка.
Название страницы "3D". Заголовок текста "Описание пространственной
структуры ….(название белка) по данным банка PDB, код 0XXX". Заголовок
выровнен по центру. Далее поместите таблицу, состоящую из одной строки
и 2-х столбцов. В левую ячейку поместите изображение Вашего белка, а
в правую текст, объясняющий, что же, собственно говоря, изображено на
рисунке.
Дополнительно: между заголовком и таблицей поместите текст с
общими характеристиками данной структуры, описанными в Вашем отчете.
Дополнительно: добавьте к таблице вторую строчку: в левую ячейку
вставьте элемент PRE (преформатирование) и в него скопируйте текст скрипта,
а в правой напишите, для чего создан этот скрипт.
-
Создайте страничку secondary_structure.html с описанием вторичной
структуры Вашего белка.
Название страницы "Secondary structure".
Заголовок текста "Описание вторичной структуры ….(название белка)".
Заголовок выровнен по центру.
Далее поместите таблицу, состоящую из одной строки и двух столбцов.
В левую ячейку поместите изображение вторичной структуры Вашего белка,
в правую текст, объясняющий условные обозначения, а также метод,
с помощью которого Вы определяли вторичную структуру.
-
Создайте страничку (ligand.html) с описанием области связывания
лиганда
Название страницы "Ligand".
Заголовок текста "Изображение области связывания (название лиганда)
с ....(название белка)". Заголовок выровнен по центру.
Далее поместите таблицу, состоящую из одной строки и двух столбцов.
В левую ячейку поместите изображение области, в правую ячейку
текст, объясняющий условные обозначения, а также метод, с помощью которого
Вы выделяли данную область.
Дополнительно: Поместите ниже (под соответствующим заголовком)
описание Вашего плана генноинженерного эксперимента.
|
|