Занятие 10: Подсказки

• Для создания новой страницы выберите пункт меню Pages – New.


• Создание структуры производится в режиме Structure (см. во второй строчке верхнего меню, крайнее левое поле).


• Для рисования структурной формулы выберите инструмент Draw normal (5-я слева кнопка в третьей строчке верхнего меню).


• Атомы выбираются из левого меню (и вставляются щелчком мыши), связи протягиваются при удерживании левой кнопки мыши.


• Чтобы превратить одинарную связь в двойную, щелкните по этой связи; следующие щелчки вернут ее в одинарную. Для изменения типа атома (например C на N) достаточно просто выбрать новый тип из панели слева и щелкнуть по объекту изменения.


• Выделенные части рисунка, например, атомы, можно передвигать. При этом будут также передвигаться ассоциированные с этим атомом химические связи. Соответственно, при удалении атома исчезают все ассоциированные с ним связи.


• Замена связи на символы "связь выходит над плоскостью рисунка" и "связь уходит под плоскость рисунка" – с помощью соответствующих инструментов из верхнего меню, третья строка.


• Если Вы хотите нанести надписи непосредственно в программе ACD ChemSketch, перейдите в режим Draw (вторая строка, второе слево поле) и выберите Edit Text (третий ряд меню, 4-я сверху кнопка). Не забудьте вернуться в режим Structure.


• Для копирования рисунка выберите инструмент Select/Move (крайняя левая кнопка в третьей строке верхнего меню), обведите рисунок прямоугольником, далее —Ctrl+C, Ctrl+V.


• Чтобы сохранить рисунок в формате GIF для размещения на HTML-странице, используйте File – Save As…, в поле File type при этом необходимо выбрать GIF Bitmaps (*.gif).


• Оптимизация рисунка (как плоская, так и пространственная) проводится с помощью соответствующих инструментов, кнопки которых расположены справа в третьем ряду меню.


• Для плоской оптимизации используется функция Clean Structure (четвертая справа кнопка в третьем ряду).


• Для объемной оптимизации используйте функцию 3D Optimization (вторая справа кнопка в третьем ряду).


• Для изображения реакции используются знаки "+" и " → " (их можно найти в середине третьего ряда меню).


• Для объединения двух аминокислот в дипептид достаточно перетянуть мышкой атом азота одной на атом кислорода другой (Будьте внимательны: перетаскивайте атом азота только на атомы кислорода, входящие в гидроксил карбоксильной группы).


• Если опция Clean Structure плохо работает (или не работает) на трипептиде, можно попробовать сначала привести структуру дипептида к традиционному виду – атомы N–Cα–C–N–Cα–C–N–Cα–C идут зигзагом (после этого, возможно, и Clean Structure сработает).


• Для покраски объекта (атома либо связи) надлежит вначале выделить их (инструмент Select/Move) в остове пептида. Выделять объекты можно различными способами:
  
  
  • Выделение одновременно группой осуществляется окружением группы элементов прямоугольником или лассо (четвертая слева кнопка в третьем ряду).
  
  
  • Выделение элементов по одному, удерживая при этом «Shift».
  
  
• Новые версии программы позволяют задавать разные свойства для объектов выделенного диапазона, разделяя их по типам (например, для атомов и связей или же различно настраивать представление одинарных/двойных связей или атомов разного типа). Двойной щелчок по выделенному объекту приводит к появлению окна Properties в котором можно задать требуемые свойства.