Занятие 6

Дополнительные задания

  1. Постройте карту локального сходства двух последовательностей с помощью программы dotmatcher пакета EMBOSS.

    Указание: это программа с графическим выводом. На вопрос "Graph type" следует ответить "ps", затем получившийся файл в формате PostScript можно открыть программой GhostView или импортировать, например, в MS-Word.

  2. Получите несколько субоптимальных локальных выравниваний двух последовательностей с помощью программы matcher пакета EMBOSS. Опишите результат.
При выполнении упражнений используйте подсказки EMBOSS
 команда -help