#pragma css /css/2010.css
<<BI>>

= Язык R и его применение в биоинформатике =

<<Href(/FBB/year_09/term8/R_course/files-kr2.zip,Файлы для второй контрольной работы)>>

[[/Grades|Сводная таблица с баллами]]

<<Href(/FBB/year_09/term8/R_course/files5.zip,Файлы для контрольной работы)>>

'''Студенты ФББ, которые ходят по понедельникам! Если кто-то из вас еще не зарегистрировался в системе, то скорее это делайте - второе и третье ДЗ закроются в понедельник в 12.45!
Если вы зарегистрировались, но вам не видно домашних заданий, срочно пишите сюда: fbbrcourse [собака] gmail.com.'''

[[https://bioinf.fbb.msu.ru/moodle/|Система для выполнения домашних заданий]]

[[https://groups.google.com/forum/?fromgroups=#!forum/fbbrcourse|Наш список рассылки]]

[[/HWInstr|Инструкция по оформлению ответов на домашнее задание]]

[[/Roster|Ведомость (студенты ФББ)]]


== Занятия ==
 1. ''13 фев.'' Введение. Знакомство с R-Studio. Базовый тип - вектор. Графики.
  [[/1/Task|Упражнение]] [<<Href(/FBB/year_09/term8/R_course/lection1.pdf,Lecture1)>>] | [[/HW1|Peзультаты домашней работы]]

 2. ''20 фев.'' Data frames. Графика.
  [[/2/Task|Упражнение]] [<<Href(/FBB/year_09/term8/R_course/lection2.pdf,Lecture2)>>]

 3. ''27 фев.'' Факторы, работа с файлами, элементарная статистика.
  <<Href(/FBB/year_09/term8/R_course/Lection3.pdf,Lecture3)>> | <<Href(/FBB/year_09/term8/R_course/files3.zip,Файлы к лекции)>>

 4. ''6 марта'' Тест Фишера, Хи-квадрат. Циклы, условия. Матрицы, списки.
  <<Href(/FBB/year_09/term8/R_course/lecture4.pdf,Lecture4)>> | <<Href(/FBB/year_09/term8/R_course/files4.zip,Файлы к лекции)>>

 5. ''13 марта'' Контрольная работа
  [[/KR1|Peзультаты]]
 
 6. ''20 марта'' Разбор КР. Еще раз про циклы, функции, статистику. Множественное тестирование.
  <<Href(/FBB/year_09/term8/R_course/Lecture6.pdf,Lecture6)>>
 
 7. ''27 марта'' Множественное тестирование. (Обобщенная)линейная регрессия.
  <<Href(/FBB/year_09/term8/R_course/Lecture7.pdf,Lecture7)>> | <<Href(/FBB/year_09/term8/R_course/MultipleTesting.pdf, Множественное тестирование)>> |<<Href(/FBB/year_09/term8/R_course/files7.zip,Файлы к лекции)>> 

 8. ''3 апреля'' Линейные модели с несколькими предикторами. Предсказания. Валидация моделей.
  <<Href(/FBB/year_09/term8/R_course/lecture8.pdf,Lecture8)>> 

 9. ''10 апреля'' Кластеризация.
  <<Href(/FBB/year_09/term8/R_course/lecture9.pdf,Lecture9)>>

 9. ''17 апреля'' Биоинформатика. Обработка данных RNA-seq, дифференциальная экспрессия генов, геномные интервалы. Набор пакетов bioconductoR.
  <<Href(/FBB/year_09/term8/R_course/lecture10.pdf,Lecture10)>>